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我国首个以牧草为主的多组学数据库平台建树

时间：2024-11-01 08:42:13 来源：

四川农业大学供图

美洲狼尾草。国首个牧

本报讯（记者张晴丹）四川农业大学牧草育种团队开拓了一个收费、多组易操作 、学数数据周全、据库建树功能多样的平台以狼尾草为主的多组学数据库平台（Milletdb），这是国首个牧我国首个以牧草为主的多组学数据库 。8月3日 ，多组相关论文宣告于《植物生物技术》。学数

美洲狼尾草一类的据库建树小米（millets）是抗非生物胁迫能耐强、营养丰硕的平台禾本科优异牧草及细粮。它可保障极其天气条件地域的国首个牧人类食粮清静，并为其余作物提供与耐非生物胁迫无关的多组遗传资源 。随着组学技术的学数快捷睁开，相关数据量激增 ，据库建树但对于大部份科研使命者而言，平台运用数据快捷开掘基因仍是挑战。当初尚未一个周全 、零星的相关多组学数据合成平台，这严正拦阻了紧张候选基因的开掘以及份子育种历程 。

Milletdb搜罗millets7个属的基因组以及1800份差距的组学数据 ，搜罗图形泛基因组学、基因组学 、转录组学、表不雅基因组学 、变异组学以及表型组学等数据。Milletdb集成为了20种适用工具，可能辅助用户从同源搜查、序列BLAST 、性状等多角度快捷识别单个基因，从多个层面构建调控收集并表征基因集，可快捷查找候选基因及其相关信息 。

相关论文信息：https://doi.org/10.1111/pbi.14136

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